Музыкальную тему фильма составляют два известных произведения Франца Питера Шуберта: «Ellens dritter Gesang» (Третья песня Эллен, или же «Ave Maria Шуберта») и «Erlkönig» (Лесной царь).

Обе эти композиции «зеркально» отображаются в сюжете.

В «Kigeki» главная героиня просит Чёрного Мечника спасти её деревню, но просит не «Деву Марию», а демоническое существо.

«Erlkönig» на стихи Гёте (в России известен перевод Жуковского) о погоне в ночном лесу — Чёрный Мечник и английские солдаты сражаются верхом, но в финале невинные люди спасены.

Утэна весьма сюрреалистична. В значительной степени на эту атмосферу работают хоралы Дж. А. Сизера. Некоторые из них разбираются в этой статье.

Одна из главных тем Zettai Unmei Mokushiroku в сериале исполняется детским хором, а в полнометражном фильме — взрослым. Возможно, тем самым подчёркивается центральная тема «Утэны»: взросление. Не случайно взрослый хор звучит перед финальным испытанием — гонкой из мира иллюзий в мир реальный.

В сцене, где девочка-робот Тима (сделанная доктором Лафтоном копия дочери герцога Рэда, чья гибель сыграла важную роль в сюжете) стояла на крыше одного из домов в рабочей зоне, звучала известная джазовая композиция «St. James Infirmary».

А в финале, во время разрушения Зиккурата, играла «I Can't Stop Loving You» в исполнении Рэя Чарльза.

В 5-й серии, когда Фэй ввязалась в поиски опасного преступника (и стала заложницей-приманкой в руках Вишеза), она явилась в театр, где шла некая опера (или концерт).

На сцене исполнялась «Аве Мария».

В конце 11-й серии, когда окончилась борьба с неведомым чудовищем, проникшим на «Cowboy Bebop», и одурманенная Фэй вместе с вещами кружилась в невесомости внутри корабля, звучал знаменитый «Вальс цветов» из балета «Щелкунчик» П.И. Чайковского.

В саундтреке использовано несколько известных классических произведений, например:
П. И. Чайковский — симфония «Манфред» си минор, соч. 58 (1885, по сюжету поэмы Байрона) — I (Lento Lugubre) и IV (Allegro Con Fuoco);
Р. Шуман — легкие пьесы для фортепиано «Детские сцены» (Ор. 15, 1838) — 7-я пьеса «Грёзы» (Träumerei).

В 1-й серии, на Луне, когда Альбер впервые увидел Монте-Кристо, со сцены звучит 2-й акт из «оперы-трагедии» Гаэтано Доницетти «Лючия ди Ламмермур» (Lucia di Lammermoor, 1935) — и загадочный граф бросает из своей ложи букет голубых роз исполнительнице главной роли.

Во 2-м акте обезумевшая Лючия, которую вынудили выйти замуж за нелюбимого человека, закалывает своего мужа... — весьма показательно для треугольника «Эдмон Дантес — Мерседес — Морсер».

Опера Джакомо Мейербера «Роберт-Дьявол» (Robert le diable, 1931) исполняется в 7-й серии, когда Гайдэ падает в обморок, увидев Морсера. В последующих сериях «Роберт-Дьявол» становится одной из музыкальных тем графа Монте-Кристо.

В 12-й серии Эжени исполняет 1-ю часть Moderato (Melody No. 1) из концерта №2 для фортепиано с оркестром (1900) С.В. Рахманинова. Это её первое публичное выступление, за которое ей пришлось заплатить высокую цену.
Пока она играет, и Альбер (которого не пустил Данглар) тайком наблюдает из-за кулис за бывшей невестой, показывают остальных героев сериала — этот эпизод является переломным во всей истории.

В 4-м фильме, когда Рип ван Винкль с подручными вампирами захватывает британский корабль и ждёт на палубе явления Алукарда, она поёт старую немецкую песню, у которой есть несколько разных названий — например, Englandlied («Песня про Англию») или Matrosenlied («Песня матросов»). Песня написана в 1939 году Гермсом Нилем на стихи Германа Лёнса и в ней повествуется о немецких солдатах, намеревающихся воевать с британским флотом. Несложно догадаться, что и по содержанию, и по идеологической установке песня как нельзя лучше подходит к ситуации.

Вся история недолгого противостояния Рип Ван Винкль и Алукарда полна аллюзий на сюжет оперы «Волшебный стрелок» (Der Freischütz) Карла Марии фон Вебер.
В опере протагонист, Макс, получил семь заколдованных пуль, которые позволяли ему попасть во что угодно, однако к последней пуле прилагался демон Замиил, который и явился к Максу в конце, когда тот был, казалось бы, на вершине успеха. Аналогичным образом Алукард — последний, в кого пришлось стрелять Рип, и она с самого начала об этом знала. Их финальное сражение (несколько одностороннего характера) протекает под музыку из вышеуказанной оперы.
Надо заметить, что Макс, в отличие от Рип, кончил достаточно удачно: Замиил забрал его друга Каспара.

В сериале широко используются музыкальные термины, кроме того, действие сопровождают мелодии классических произведений.
Увертюра Вагнера к опере «Нюренбергские мейстерзингеры» открывает первую серию.
Мотив, который Куон постоянно напевает или мурлычет себе под нос, — это «Половецкие пляски» из оперы Бородина «Князь Игорь». В течение всего сериала эта мелодия неоднократно звучит из различных акустических систем.

Безусловно, в музыкальном сериале про участников симфонического оркестра невозможно обойтись без классики, однако саундтрек «Нодамэ Кантабиле» состоит не только из тех произведений, которые исполняют герои.
Например, вариации на тему «Лунной сонаты» Бетховена (успевшей превратиться в «попсу») подчёркивает комичность некоторых как бы трагичных моментов.

Заметную роль здесь играет «Концерт для фортепиано с оркестром № 5» Бетховена. Это произведение слушал Терумити Мадока – человек, действия которого послужили основной для событий сериала.
Также звучит музыка из оперетты Франца Легара «Весёлая вдова», а башня Турангалила названа в честь «Турангалила-симфонии» Оливера Мессиана.

Один из трёх антагонистов сериала, бисёнен и нарцисс Леонардо Медичи Бандл любит, чтобы всё было красиво, — и устраивает сражения под классическую музыку. В боях, которыми он командует, звучат Концерт №5 из Бранденбургских концертов Баха, произведения Шопена, Вагнера и другие известные произведения.
С одной стороны, это характеризует персонажа, с другой — ненавязчиво знакомит зрителя с классикой мировой музыки.

6-я серия связана с музыкой — вернее, музыка связана с деятельностью «хостов». Чтобы убедить ученика продолжить заниматься пианино, учитель говорит: «Если станешь пианистом, у тебя появится много поклонниц!» Но у мальчика «мало времени», и он напрашивается в ученики к Тамаки, впрочем, без толку.
В итоге Хост-клуб берётся за расследование, и вскоре находит мальчишку в музыкальном классе.

Девочка, в которую он был влюблён, предлагает порепетировать вместе, но поскольку есть только оно пианино, играет в одиночку — получается у неё превосходно. Исполняет она Сонату ре мажор для двух фортепиано Моцарта (K448).
Узнав, что именно заставило мальчишку записаться в «хосты», Тамаки исполняет для него вторую партию сонаты Моцарта — на белом рояле, который всегда был в Хост-клубе, так как тот размещается в Музыкальном классе №3.
В финале серии влюблённые играют вместе.

Насколько визуальная сторона сериала создана под влиянием стилистики нуар-комиксов, настолько и саундтрек, написанный Сахаси Тосихико, содержит множество отсылок и цитат к классике и музыке из шпионских, научно-фантастических и нуар-фильмов. Например, музыкальная тема для битв перекликается с саундтреком «Годзиллы» Ифукубэ Акиры.
Основной опенинг «Big-O! Show Must Go On» Нагая Руи — это своего рода ремикс на заглавную тему к фильму «Flash Gordon», написанную группой Queen.

Также в сериале звучит «Прелюдия № 15» из опуса №28 Ф. Шопена.

Джазовую вариацию на мотив известнейшей рождественской «Jingle Bells» исполняет на саксофоне уличный музыкант Оливер в 11-й серии, посвящённой «Небесному Дню» — аналогии Рождества в Парадигм-Сити. 40 лет назад все люди утратили память, и то, что Оливер играет, является обрывками Воспоминаний.
Сыграть «что-нибудь особенное» его попросил Роджер-Посредник, и пока звучит музыка, Роджер и андроид Дороти обмениваются подарками — стоя под лапами чудовищной ёлки, которая едва не разрушила купол города…

Идёт спасательная операция, в которой нужна хирургическая точность. Горо меняет компьютерные расчёты и работает , полагаясь на собственное чутьё. В этом случае вся ответственность падает только на него.
Риоко (сотрудница главного отдела, отвечающая за кандидатов в астронавты от компании) звонит на мобильник Горо, который всё больше впечатляет её. Она знает, что рингтон у него «Air on the G String» И.С. Баха, и когда всё закончилось, Горо перезванивает и, правильно поняв её, спокойно спрашивает: «Эй, как называется мелодия твоего звонка?» — «Волшебная Флейта Моцарта» — с волнением отвечает Риоко новоиспечённому герою.

В фильме есть замечательная сценка под названием «Сожаление».
Вся сцена построена на том, что играет характерная трагическая музыка: Симфония №1 Малера, 4-я часть «Гигант».

Первая сценка «Свадьба» — свадьба самих Ямада.
Играет традиционный в таких случаях «Свадебный марш» Мендельсона.

А перед выступлением на свадьбе, когда Отец говорит речь с пожеланиями молодоженам, играет «Игрушечная» или «Детская Симфония» (2-я часть Minuet).

«Свадебный марш» Мендельсона звучит в 23-й серии — во время объявления о предстоящей свадьбе и причинах бракосочетания и в процессе самого торжества. Традиционная музыка подчёркивает «контрастность» момента: человечество буквально стоит на краю гибели — и вдруг происходит столь ординарное, мирное событие!..

В шестой серии на протяжении всей сцены гибели (развоплощения) Нуэ и его младшего брата звучит «Адажио» Томазо Альбинони в исполнении Пражского симфонического оркестра. Звучит полностью.

В 1-й серии есть сцена, где Игги везёт Рил в машине, включив музыку и болтая о то, о сём. Но Рил не до разговоров. Сначала она приказывает автолейву отключить голосовую систему, а потом пультом выключает музыку — и наслаждается поездкой в полной тишине.

Примечательно, что сериале звучит оригинальный саундтрек, использование «чужой» музыки — редкость.

Игги слушал «Die Moldau/Влтаву» Бедржиха Сметаны.
Это произведение входит в цикл симфонических поэм «Моя Родина», написанных этим известным чешским композитором в 1874-1879 годах. В «Моей Родине» Сметана объединил форму симфонической поэмы, разработанную Ференцем Листом, с чешскими национальными мотивами.
«Влтаву» композитор посвятил одной из крупнейших чешских рек. Наигрыши флейт в начале поэмы изображают спокойное течение Влтавы, звуки труб и валторн — охоту в лесу на её берегах и т.д.

В 10-й серии после неудачной попытки признания в любви Фудзио и Акира сидели на уроке музыки в подавленных чувствах, а в это время играла вторая часть 9-я симфонии Бетховена.

Ближе к финалу фильма, когда один из бомжей отдает деньги медсестре и крупным фоном показываются купюры, еле слышно звучит отрывок из «Оды к радости» (9-я симфония Бетховена). Главный герой копил эти несчастные «копейки» для своей дочери, но в итоге решил потрать их на лечение друга, когда тот попал в больницу. Вскоре после этого выяснится, в этой же больнице работает медсестрой его дочь.

В конце 13-й серии все девочки, кроме больной Анжелики, выехали посмотреть на звездопад. Клаес предположила, что Анжелика, возможно, тоже смотрит на небо и напевает при этом 9-ю симфонию Бетховена, на что Триелла заметила, что «к такой ночи девятая симфония подходит». Генриета напела мотив и остальные девочки его подхватили. В это время Анжелика слушала 9-ю симфонию, доносящуюся из магнитофона...

В 8-й серии Клаэс обсуждала с другими людьми старинную английскую балладу «Scarborough Fair» (Ярмарка в Скарборо), смысл её слов и её значение.
В небольшом садике Агентства Социального Обеспечения она посадила петрушку, шалфей, розмарин и тимьян, о которых поётся в припеве баллады.
В конце серии звучала и сама баллада.

В 9-й серии зашла речь о знаменитой опере «Tosca» Джакомо Пуччини. Наставники рассказали девочкам о сюжете оперы и её значении. Затем Генриетте и Рико выпал случай побывать на этой опере, но не для того, чтобы насладиться музыкой и пением, а для убийства торговца оружием. Позже девочки с сожалением отметили, что из-за работы им толком не удалось послушать оперу.

На кадре статуя, рядом с которой происходит финальное действо «Тоски».

Слегка переделанная, но вполне узнаваемая мелодия «Собачьего вальса» звучит в самых комичных сценах сериала, а также сразу после опенинга — при объявлении спонсоров.
Юмор в том, что сериал посвящён кошачьим прихотям. Но собаки там тоже упоминаются: родители Мидзуно Каэде (в которую влюблён главный герой) держат дома собак, а вот их дочь обожает кошек.

Рика — хозяйка небольшого рекламного агентства, где подрабатывает Маяма. Его безответная любовь к Рике не угасает, несмотря на то, что она старше и не воспринимает его как «мужчину». А он вопреки всему продолжает думать о ней… и о той мелодии, которую она напевала однажды ночью, когда работники спали, устав после празднования сдачи проекта. Песня называется «Moon River» (Лунная река).

Маяму тогда поразило, что Рика поёт (и, возможно, тогда он впервые понял, что влюблён).
Он не только выяснил, что это за мелодия, но даже записал её в качестве «звонка» на свой мобильник (и вредный Морита издевался над ним по этому поводу).

Маяма не знал, что песню «Moon River» Рика и её покойный муж услышали в кино, и эта песня стала для них чем-то вроде талисмана.

Во 2-й серии значительную роль играет песня «Голубые огни Йокогамы».
Эта песня была выпущена в 1968 году и исполнена известной эстрадной певицей Аюми Исида. Впоследствии стала классикой мировой эстрады.
«Голубые огни Йокогамы» перепевали многие звёзды, например, Мерей Матье.
В России песню исполняли как на переведённые слова, так и на «народные»:

В эндинге звучит оркестровая интерпретация песни, которая в титрах обозначена как «When Johnny Comes Marching Home». В действительности она называется иначе.

В начале XIX века в Ирландии анонимный автор написал песню под названием «Johnny I Hardly Knew Ya» («Джонни, я едва тебя узнала») о солдате-инвалиде Ост-Индской компании, вернувшемся домой к жене и детям. Эта песня, точнее, её мелодия, успешно пересекла Атлантику, но тема ужасов колониальной войны за Цейлон, по всей видимости, была не слишком близка молодой американской нации. Поэтому в Америке возникло несколько новых текстов на ту же мелодию, из которых самым популярным был написанный ирландцем Патриком Гилмором, воевавшим за северян. В его варианте песня называлась как раз «When Johnny Comes Marching Home».
Патрик Гилмор в агитационных целях вывернул текст «Johnny...» наизнанку и превратил песню в юнионистский марш. Однако, это не помешало американцам уже в 1960-х годах вспомнить оригинальные слова «Johnny I Hardly Knew Ya». Антивоенный пафос песни пришёлся особенно кстати в разгар войны во Вьетнаме (1964-1965 годы). Эту песню тогда исполнял пожалуй что каждый «фолксингер».

И немалую долю впечатлений от просмотра OVA составляет именно контраст между сюжетными реками крови и пацифистским гимном в эндинге.

Песенку «Хеппи-бёсдэй-ту-ю» Нацки репетирует со всеми родными, чтобы спеть на дне рожденье у бабушки.
Однако бабушка умирает.
Люди приходят почтить её память…
…и с удивлением наблюдают, как осиротевшая семья радостно поёт эту самую песенку.

«Галоп» Кабалевского звучит во время бегства по школьному коридору (на 17-й минуте 3-й серии).

Вообще это одна из самых популярных композиций, которые звучат на школьных празниках в Японии, поэтому «Галоп» нередко используются в комедийных школьных ситуациях (например, в «Azumanga Daioh»).

«Галоп» Кабалевского звучит во время умопомрачительного спуска-полёта Фумико (и прекрасно подходит к сюжету короткометражки).

«Галоп» Дмитрия Борисовича Кабалевского (1904-1987) входит в сюиту «Комедианты» (соч. 26, из музыки к пьесе «Изобретатель и комедиант» М. Даниэля, 1940).

Сюжет шестой серии связан с Арийским Социалистическим Союзом и «наследством» Гитлера — не случайно музыкальной темой стал «Полет валькирий» Вагнера: эта музыка звучит на корабле неонацистов.

События 12-й серии во многом состоят из воспоминаний главных героев. Например, становится известно, что каждый из них задал «важный вопрос» монаху Зукои, у которого они остановились на несколько дней (10-я серия).
Значимость момента была подчёркнута торжественной музыкой: звучала известнейшая (и успевшая всем надоесть) тема из «Космической Одиссеи» Кубрика.
А потом Муген сообщил, что хочет стать самым сильным и победить врага. И тут же получил по башке…

Когда Синдзи впервые встречается с Каору, тот играет на забытом в полуразрушенном доме рояле «Оду к радости» из Девятой симфонии Бетховена (в аниме — просто напевает её). Она же звучит, когда они прощаются. «Ода» недаром «к радости» — всё, что произошло, наверное, к лучшему, но именно мажорность музыки и вроде бы положительный исход и придаёт особый трагизм ситуации.
При встрече Синдзи легко опознаёт это музыкальное произведение, однако, кажется, впервые действительно вслушивается в него, ведь впервые музыка приобретает для него человеческое лицо.
«Ода радости» также звучит во время проникновения Каору в Центральную Догму и битвы его и Синдзи.

В саундтреке «Neon Genesis Evangelion» присутствует несколько произведений И.С. Баха. В сериале и начале «Смерти и перерождения» Синдзи играет Сюиту для виолончели N1 (BWV 1007), далее по ходу фильма звучит фрагмент Партиты N3 (BWV 1006).
В «Конце Евангелиона» основной темой перед началом Комплементации является «Air» — часть Овертюры N3 в D мажор (BWV 1068).

В первоначальной версии фильма во время Комплементации есть длинный live-action фрагмент, показывающий мир без Синдзи и без Евангелионов, где Аска, Рей и Мисато живут обычной жизнью. Когда Аска опаздывает на работу, мы слышим «Jesus bleibet meine Freude» (BWV 147).
В финальной версии вместо этого фрагмента вставлен коллаж из видов мегаполиса (вероятно, Токио-3), сцены с Рей, Аской и Мисато и кадров зрительного зала, которые были вмонтированы в фильм непосредственно перед показом. Все это так же сопровождается «Jesus bleibet meine Freude».